Dilansir CilacapUpdate dari laman resmi LTMPT, berikut daftar SMA unggulan di Kabupaten Halmahera Timur yang masuk top 1000 sekolah terbaik di Indonesia:
1. SMA NEGERI 3 HALAMAHERA TIMUR
- Rata Rata Nilai
- BAHASA INDONESIA: 46,15
- BAHASA INGGRIS: 40,89
- MATEMATIKA: 30,83
- RERATA NILAI: 39,83
2. SMA NEGERI 1 HALMAHERA TIMUR
- Rata Rata Nilai
- BAHASA INDONESIA: 54,62
- BAHASA INGGRIS: 53,69